Phenotypic and genotypic characterization of Rhodococcus equi isolated from sputum

INTRODUCTION: Rhodococcus equi is an opportunistic pathogen, causing rhodococcosis, a condition that can be confused with tuberculosis. Often, without identifying M. tuberculosis, physicians initiate empiric treatment for tuberculosis. R. equi and M. tuberculosis have different susceptibility to drugs. Identification of R. equi is based on a variety of phenotypic, chromatographic, and genotypic characteristics. OBJECTIVE: This study aimed to characterize bacterial isolates from sputum samples suggestive of R. equi. METHODS: The phenotypic identification included biochemical assays; thin-layer chromatography (TLC) and polymerase chain reaction (PCR) were used for genotypic identification. RESULTS: Among 78 Gram-positive and partially acid-fast bacilli isolated from the sputum of tuberculosis-suspected patients, 51 were phenotypically and genotypically characterized as R. equi based on literature data. Mycolic acid analysis showed that all suspected R. equi had compounds with a retention factor (Rf) between 0.4-0.5. Genotypic characterization indicated the presence of the choE gene 959 bp fragments in 51 isolates CAMP test positive. Twenty-two CAMP test negative isolates were negative for the choE gene. Five isolates presumptively identified as R. equi, CAMP test positive, were choE gene negative, and probably belonged to other bacterial species. CONCLUSIONS: The phenotypic and molecular techniques used constitute a good methodological tool to identify R. equi.

Isolamento, caracterização e resistência a antimicrobianos de bactérias Gram-negativas aeróbias e anaeróbias facultativas de amostras de solo / Isolation, characterization, and antimicrobial resistance of Gram-negative aerobic and facultative anaerobic bacteria from soil samples

Cerca de 7% da população bacteriana do solo está representado por bactérias Gram-negativas aeróbias/anaeróbias facultativas. Muitas espécies são patogênicas e estão envolvidas em casos de infecções hospitalares. O potencial de patogenicidade dessas bactérias pode ser avaliado através da investigação da sua resistência a antimicrobianos. Além deste propósito, o objetivo do trabalho foi também identificar bacilos gram-negativos (BGN) isolados do solo. Para isso, 18 amostras de solo foram semeadas em caldo de Hajna. A obtenção de colônias isoladas seguiu-se em Mc Conkey ágar e Mueller Hinton ágar com 5% de sangue de carneiro. Foram repicadas 283 colônias com diferentes características morfológicas, em meio de IAL. Na triagem, obteve-se BGN fermentadores e não fermentadores, cuja identificação se fez pela metodologia convencional. Identificou-se 94,35% de enterobactérias e 5,65% BGN não fermentadores. A resistência bacteriana foi mais expressiva aos antibióticos ampicilina, cefalotina, cefoxitina, amoxicilina com ácido clavulânico e tetraciclina, variando entre 49,82% a 87,28%. Todos os isolados bacterianos foram resistentes a pelo menos um antibiótico, o que demonstra considerável potencial patogênico por constituírem um reservatório de resistência. A associação entre solo e resistência antimicrobiana precisa ser mais estudada. Observações e experimentos adicionais possibilitarão conhecer melhor essa relação e os processos que possam contribuir para a emergência de bactérias resistentes.